重要经济命脉，使叶赫部经济萧条。因此，攻取辉发部对于努尔哈赤统一东北地区具有重要的战略意义，也是他近攻策略实施的第二个重要步骤。
万历三十五年（公元1607年）九月，辉发部首领拜音达理，与族人发生了矛盾，其叔父等七人被杀死。众兄弟族人纷纷离开本部，投向叶赫部。不久，其余的部众也离心离德，准备外投。拜音达理见形势不妙，又没有力量对付叶赫部，就以本部七个村寨大臣的儿子作为人质，请兵于努尔哈赤。努尔哈赤及时地发了一千兵相助。叶赫部得知建州出兵，就秘密遣使到辉发部，对拜音达理说，如果辉发部取回送往建州的质子，我部将归还你部的人员。拜音达理信以为真，得意地说：我将生于叶赫部与建州部之间［23］，并撤回送往建州的质子，转送到叶赫部去了。叶赫部得了人质以后，食言背约，没有返还辉发部的人员。拜音达理受了欺骗，心中不满，又派使臣转告努尔哈赤。自悔地说：昔日我误信了叶赫部的话，受骗上当了，今日仍然想依靠汗来为生，并愿结婚约。努尔哈赤答应了他的请求。时间过了不久，拜音达理又违背了成约。努尔哈赤派遣使臣责备他说：你曾经帮助叶赫部两度侵犯我的边境，今天又聘女不娶，道理何在？拜音达理掩饰说：我质子于叶赫部，待其归来，即刻成婚。而心中却另有打算，即大兴土木，筑城三层，借以自固。城已经修筑完了，质子也归来了。努尔哈赤又派使臣催婚说；你的质子已经回来了，今天你的意下又如何？拜音达理自以为城池坚固，易守难攻，毅然撕毁了与建州的婚约。因此，建州与辉发两部的战争，终于爆发了。
努尔哈赤的用兵，一向是先礼后兵，对于主动归附的部落施以盟誓或联姻。而对于抗拒不从的部落则兵临城下。鉴于拜音达理反复无常，不守信约，又自认为有险可守，努尔哈赤决意发兵讨伐。于是，他与众贝勒商定攻城办法，即采取派人先打入辉发城作为内应，以轻骑突袭，行夹攻破城之计。因此，建州在攻取辉发城的前数天，以十多个精兵为一伙，扮作生意人，持货进入辉发城，潜伏在城内。先后派出十多起，多达百余人。他们详查了辉发城内情况，伺机而动。在辉发部毫无察觉的情况下，努尔哈赤亲自统率大军，随营八十八将，日夜兼程，疾驱辉发大城。七、八天的路程，只用六天就赶到了。
建州兵开始攻城，潜伏城内的军率立刻响应，刹时间，辉发城内大乱，杀声、喊声响成一片。战不多时，城门失守，努尔哈赤率领轻骑兵冲入城中。辉发首领拜音达理，在慌乱中率兵奋力抵抗，大战多时，辉发城终于陷落了。这次战斗很激烈，拜音达理父子都战死了，建州军队也伤亡惨重，光大将就战死了六名［24］。
努尔哈赤征服哈达、辉发两部以后，同乌拉部的矛盾又激化了，原因是反映在经济、政治两个方面。从经济方面的利害关系来说，控制乌拉部的毛皮物产，增强建州实力，满足以努尔哈赤为代表的建州奴隶主们的欲望，已经是如饥似渴了。早在万历二十七年以前，努尔哈赤就想利用猛骨孛罗与乌拉布占泰的叔侄关系，吸引乌拉等部土产通过抚顺关与汉区交易，以谋取巨利。不料，猛骨孛罗使努尔哈赤大失所望。万历二十六年（公元1598年），乌拉布占泰又将毛皮产地瓦尔喀部内的安楚拉库、内河二路的三位路长许献给叶赫部那林孛罗。当努尔哈赤派遣重要将领统兵夺取安楚拉库、内河二路以后，乌拉部、叶赫部与建州的关系进一步恶化了，其中经济得失是主要因素。但当时哈达部、辉发部尚未灭亡，努尔哈赤对乌拉部的方针是以远交为计，适宜的以武力相威胁，和平是两部关系中的主流。为了得到松花江、黑龙江和图们江等各处貂、参、珠等贸易的好处，努尔哈赤采取种种手段，博取东海和乌拉各部首领的欢心。比如，东海三部（虎尔哈、窝集、瓦尔喀）的一些路长，因为鸟拉布占泰的“焚盪”和慑于建州的武力威胁，一部分附属乌拉布占泰，一部分比较主动地与努尔哈赤结交。万历二十七年（公元1599年）正月，东海窝集部内虎尔哈路（在图们江西侧）二位路长王格、张格率领一百多人前来建州贡献黑、白、红色狐皮，黑、白二色貂皮。努尔哈赤为了远交三部，以六位大臣的女儿配给路长博济里等六人。从此，东海虎尔哈部岁岁入贡。万历二十九年（公元1601年）一月，布占泰贝勒送女给努尔哈赤为妃，并要求努尔哈赤再许配一女给他为妻。努尔哈赤慨然应允，将舒尔哈齐的另一个女儿娥恩哲于万历三十一年（公元1603年），送往乌拉部成婚。万历三十六年（公元1608年），乌拉兵败于宜罕山城（今吉林省吉林市龙潭山城），布占寨贝勒大惧，为了缓和关系，表示友好，再次恳请努尔哈赤许配亲女为婚，并发誓：若是得了努尔哈赤的亲生女儿，将永远依赖建州为生。努尔哈赤又答应了他的请求，将亲生的女儿穆库什给布占泰为妻［25］。建州连妻三女给布占泰，其目的就是通过政治联姻关系，结交乌拉布占泰，以图貂、珠的利益［26］。在政治方面，由于叶赫、建州两部都强大，势不两立。乌拉部虽然心向叶赫部，而表面上也不得不对建州亲热一点，似有持于两端，不稍偏重一边的样子，而叶赫、建州两部都视乌拉部为助力，千方百计地结交乌拉部。
乌拉布占泰是一名颇有作为的大首领，别号叫何叱耳（即左弓之意）［27］，当时有四十多岁，善于弓马，标悍异常。努尔哈赤在南方治国强兵，布占泰在北方设法壮大自己。朝鲜王国边防体察使韩孝纯描绘当时的情形时说，老酋（指努尔哈赤）崛强，忽酋（指布占泰）继起，而两者都知道治兵自强［28］。万历二十四年（公元1596年），满泰父子遇难，布占泰贝勒回乌拉部，继为首领。他积极治兵，以求发展。他两次送婚，三次娶亲于建州，都是为了创造发展自己的有利环境，即用政治联姻的方法，达到防犯建州干涉的目的［29］。足见，布占泰的能力和才干也是非凡的。
对于布占泰治国强兵的方针，满泰的子孙很有不同的看法，他们讥笑布占泰不知好歹，不会享受荣华富贵，偏去整军设防［30］。在当时各部争强的形势下，布占泰的作法是有见识、有作为的。他房住建州三年多，对于努尔哈赤治国强兵政策是深为理解的。布占泰对外以联合叶赫、科尔沁蒙古为主，对建州基本上采取和平相处的方针，把主要精力放在壮大自己势力的基点上。因此，在对朝鲜六镇（系指会宁、稳城、钟城、庆源、庆兴、茂山，皆在今咸镜道北）“藩胡”（即六镇周围的女真人）问题上，与努尔哈赤发生了激烈的争夺，他们都想将这一部分女发人收归为自己的羽翼。因此，竟演变成两部之间你死我活的争斗。
对于朝鲜王国六镇周围的女真人，布占泰也想如努尔哈赤的办法，收为羽翼，而努尔哈赤从万历二十六年（公元1598年）收服内河路、安兹拉库路，第二年又收服窝集、虎尔哈等部，大有吞并东海各部之势。他在暂短的时间内，几乎把朝鲜会宁以西的各部女真都收归了建州，兵力大为增强［31］。对此，乌拉布占素心急如焚，生怕东海各部都被建州夺去。所以，万历三十一年（公元1603年）九月，布占泰兵分三路。以二路向钟城进攻，将东海钟城近地的女真各部“焚盪”无遗，获取牛、马五百多匹，男、女人口数以千计［32］。同年十二月，又以大兵向稳城女真进攻，并直捣庆源周围，大掠而归［33］。
乌拉首领布占泰的卓见就在于他善于审时度势，既坚持军事戟，又采取灵活的外交手段。他看到努尔哈赤在统一战争中逐步强大起来，其办法之一就是掠取诸部，把会宁以西女真各部人口尽量地移人建州腹地，实力越来越强。因此，布占素也如此办理，向钟城、稳城、庆源周围的女真各部进兵，“踵老酋之后”，大掠朝鲜六镇“藩胡”，致使乌拉部兵将和人口激增，势力渐大［34］。
布占泰力量不足，每出兵必请叶赫、蒙古各部协助，因此，攻势迅猛［35］。到万历三十四年（公元1606年）七月，布占泰的兵锋所至已达悬城女真各部了，并且水、陆并进，人、畜、谷物等尽行掠取、迁移［36］。万历三十五年（公元1607年）正月，又发兵攻取瑚叶路（今苏联东滨海省境内达乌河流域）诸部，一个时期，六镇周围及其东北各部女真都听从布占泰的号令。
乌拉布占泰在军事上一系列的胜利，早已引起努尔哈赤的严重关注，凡是布占泰的动静，不论事情大小，努尔哈赤都侦察入微，并且及时的向广宁总兵通报。目的是既取得边官的信赖，也为自己采取军事行动寻找借口和扫清障碍。因此，乌拉部与建州部在东海女真问题上已经酝酿着一场大的冲突。为了进一步排除进军东海女真各部的阻力，努尔哈赤通过外交途径，求得朝鲜王廷的谅解。以布占泰受朝鲜王廷的“职贴”为名，努尔哈赤也派遣一名副将到满浦镇，请朝鲜国王以对待北方“藩胡”的惯例，乞求到朝鲜王国京城受职。朝鲜国王以努尔哈赤受明廷龙虎将军重职，非一般首领可比，而婉言拒绝了［37］。成历三十五年（公元1607年），乌拉部与建州部终于在争夺朝鲜王国六镇“藩胡的问题上爆发了战争。这一年，东海瓦尔喀斐优城（今吉林省珲春县三家子公社高丽城村）主策穆特赫来到建州，向努尔哈赤表示：我部遥远，不得已归附了乌拉部，希望派兵前去接取家眷，愿意到建州来生活。同年三月，努尔哈赤命令其弟舒尔哈齐贝勒、长子洪巴图鲁（即褚英）贝勒，次子代赞贝勒与大臣费英东、扈尔汉等，率兵三千向斐优城进发。从派遣的将领看，努尔哈赤对这次行动相当重视，对其后果也并不是没有考虑的。斐优城近朝鲜的悬城，建州兵到斐优城以后，把城周围屯寨的居民近五百户，全部收来［38］。同时，致书朝鲜王国边镇官员，说明这次出兵没有侵犯王国的意思，相反，还归还了部分被掠来的朝鲜王国的人口，表示友好。书中要求凡是进入朝鲜王国的女真人，希望送还给建州部［39］。努尔哈赤的这一外交行动，进一步为建州进兵扫清了道路，使朝鲜王国边防军保持中立。
舒尔哈齐贝勒等收取五百户以后，命令费英东、扈尔汉先率兵三百，护送先行，当护送队伍走到钟城地界时，突然受到万名乌拉兵的阻截，处境十分危急。费英东、扈尔汉立刻采取紧急措施，一面急令五百户结阵于山巅，即朝鲜人所称的乌碣岩，以一百兵守卫。另以二百兵与乌拉兵相峙。同时，驰报后继诸贝勒。第二天，乌拉兵前来挑战，建州大将杨古利率众奋勇迎击，阵斩乌拉七人，乌拉兵被迫后退了。两军各自隔江扎营。傍晚，舒尔哈齐等后继众贝勒赶到。褚英、代善见众兵畏敌，便鼓励士兵说：乌拉布占泰是我军的俘虏，曾经铁锁系颈，免死以后放回去的。他的兵虽然多，我们有汗父素著的威名，这一仗我们必胜无疑。众兵听后，欢跃振奋，士气大振。
第二天的上午，乌拉与建州两军接战。乌拉大将博克多贝勒父子率先冲阵而出，战不几合，被代善生擒过来，父子都被斩于马下。次将常住、胡里布也战败被擒。乌拉众兵见主将失利，纷纷溃散［40］。建州兵随后勇猛奋击，交战十分激烈。自午时战至日暮。建州兵势如摧枯拉朽，乌拉兵死伤累累，仅死于朝鲜王国境内的就近三千人，战死在女真地方的也有五、六千人，合计有七、八千人［41］。战后，建州获得马五千匹，甲五千副，大获全胜。这就是有名的乌碣岩大战。
大军凯旋后，努尔哈赤奖励战将，各赐以名号。舒尔哈齐被赐名为达尔汉巴图鲁（蒙古语，荣誉的勇士）。长子褚英奋勇作战，赐名为阿尔哈图图们（蒙古语，有智谋的万户），代善与其兄并力杀敌，擒斩乌拉主将博克多父子有功，赐名为古英巴图鲁。
乌碣岩大战使乌拉与建州两部的力量对比发生了有利于建州的变化。战前，乌拉兵力盛于建州，战争中努尔哈赤的军队既消灭了乌拉的有生力量，又收编东海女真兵多达五、六千，作为心腹，兵势之盛，雄于诸部，各部女真纷纷归附。乌拉部的士气大挫，从此。对建州兵不敢轻易迎锋了［42］。。
在乌拉与建州矛盾日益尖锐的情况下，布占泰深感力量不足，便与叶赫部进一步携手，与科尔沁蒙古密切关系，以对抗建州。万历三十六年（公元1608年）三月，努尔哈赤令长子褚英，侄儿阿敏率兵五千，前去攻击乌拉部的宜罕山城，斩杀了一千多人，得甲三百副，城中人、畜都被收过来。建州大军回来时，布占泰贝勒虽然与科尔沁翁阿岱合兵追出了乌拉大城二十里，但未敢迎战，眼巴巴地看着建州兵返程了［43］。
万历四十一年（公元1613年），乌拉布占泰与建州努尔哈赤的关系，随着建州统一事业的发展，进一步恶化，终于爆发了导致乌拉部灭亡的战争。战争的具体原因是，努尔哈赤虽然三次嫁女给布占泰，结其欢心，结果却使努尔哈赤大失所望。因此，努尔哈赤指责布占泰七次背盟。同时，建州奴隶主集团独占了北方貂、参、珠等之利，使开原人与叶赫人大为不满，他们彼此相谋说：将努尔哈赤与叶赫约婚的老女，转嫁给乌拉布占泰，挑起乌拉部与建州部之间的冲突。布占泰早已内心倾向叶赫部，对于建州奴隶主们压低貂、参价格，不给平价颇有怨气。又知道叶赫老女为当代的绝色，叶赫部主动送来衣服、鞋子等物，便对建州三女逐渐疏远了，并以骲箭射努尔哈赤之女。建州三女不肯受辱，向努尔哈赤诉苦。加上布占泰又两次与建州争夺东海虎尔哈部，这就导致了两部进行最后的较量。
建州与乌拉两部继宜罕山城战后，再次发生冲突。万历四十二年（公元1614年）九月二十二日，努尔哈赤统率三万大兵向乌拉进发，二十九日抵乌拉境内，沿乌拉河行进。张扬黄盖、鸣号角，击鼓向前，以示兵威，直达乌拉大城的河对岸列阵。乌拉布占泰贝勒见敌兵大至，决定不与建州兵决战，采取白天出兵袭击，夜间收兵休息，以疲劳建州兵卒的战术。努尔哈赤的五子莽古尔泰、八子皇太极两贝勒，想渡乌拉河主动进击。努尔哈赤告诫说：你们所说的话，象浮面取水那样容易，凡是遇事都应当深虑。象伐大木吧，哪能一下子骤然折断，必须以斧子先砍，逐渐砍断。两个相等的国家，怎么能一举歼灭对方？于是，下令先将乌拉大城周围的各个小城攻占，以孤立乌拉城。又令军士纵火，把沿河六城的房屋、谷物全部焚毁。
乌拉布占泰见沿河六城被焚，财物尽被烧毁。接着又有五城失守，而建州还没有退兵的意思，十分着急，便派遣大臣吴巴海巴图鲁乘船到努尔哈赤军营的对岸，对建州使臣说：汗父兴兵到此，不过是一怒之下而为之。今天敬请息怒，可否留下话退兵。努尔哈赤对于乌拉来使不予理睬。布占泰贝勒三次遣使求和，努尔哈赤都不肯接见。布占泰贝勒只好亲自率领六员大将，乘船前来拜见。努尔哈赤得知布占泰前来求见，便身披明甲，胯下骑着白马，从军中走出，步入乌拉河，水至马腹，站立河中。布占泰看见汗亲自出营，慌忙叩头，恳求说：乌拉部就是汗父的部，乌拉的谷也是汗父的谷，请不要焚