原来，2 月末，麦克阿瑟派了1000 名美军，对阿德默勒尔蒂群岛最东边的洛斯内格罗斯岛进行了一次火力侦察。虽然进攻部队的兵力不及守岛日军的四分之一，但凭借强大的海空火力支援，美军很快登上了这个岛。紧接着后续部队蜂拥而上，完全占领了洛斯内格罗斯岛和附近更大的马努斯岛。从某种意义上说，阿德默勒尔蒂群岛取代了被绕过的腊包尔，因为毗连马努斯岛和洛斯内格罗斯岛，有一个长15 海里、宽4 海里的锡亚德勒湾。
早在麦克阿瑟部队进攻阿德默勒尔蒂群岛之前，参谋长联席会议就已经发现锡亚德勒港的优越性。港的一边是洛斯内格罗斯岛，那里地势平坦，适于修建机场。飞机从岛上起飞可以一直飞到帕劳群岛和马里亚纳群岛进行侦察，有利于孤立日军在特鲁克岛和加罗林群岛的其他基地，并可支援对新几内亚的进攻。港的另一边是面积较大和多山的马努斯岛，足可修建一个海军基地。这个港湾完全可以用来作为从海上进攻新几内亚、帕劳群岛、菲律宾和台湾的出发地。
鉴于太平洋海军司令部配属有海军营建大队和勤务部队，马歇尔将军建议麦克阿瑟委派哈尔西将军负责修建马努斯一洛斯内格罗斯基地设施的工程。于是，尼米兹致函金上将并抄送麦克阿瑟，建议将阿德默勒尔蒂群岛划归南太平洋地区管辖，以便于统一指挥。南太平洋地区是太平洋战区中北、中、南次战区中的一个。
麦克阿瑟本来就对尼米兹变卦耿耿于怀，又见尼米兹要从他手中夺走阿德默勒尔蒂群岛，于是认定尼米兹的建议怀有侵占他的地盘的企图。他写信给马歇尔表示抗议，指责尼米兹建议参谋长联席会议让他交出阿德默勒尔蒂群岛损害了他的“个人荣誉”，侵犯了他的完整指挥权。他要求尽早让他亲自去向陆军部长和总统陈述意见。
写完信后，他又把哈尔西叫来商议对策。哈尔西后来回忆道：
甚至连一句问候话还没来得及说，我就发现麦克阿瑟在极力压制着他的怒气。他指责我、尼米兹、金和整个海军企图以险恶的阴谋来削弱他的权力。他说了一刻钟左右，阐明了两个意思：他决不屈从于这种干涉；他已发出命令，在马努斯的管辖权确定之前，工程仅限于为他直接指挥下的舰只——第7 舰队和英国舰艇——提供必要的设施。
马歇尔接到麦克阿瑟的信，觉得太平洋战场上陆海军的分歧已到非解决不可的时候了。他回信给麦克阿瑟：
除非你自己放弃指挥权，否则在你地区内的所有基地设施都归你指挥。。你在指挥上的完整性和个人的面子都没有问题。。但是，如果你想晋见陆军部长和总统谈这个问题或其他问题，我随时都可以为你安排。
为了解决麦克阿瑟和尼米兹的分歧，参谋长联席会议决定召回尼米兹和麦克阿瑟，到华盛顿讨论下一步的战略决策，确定进攻日本的最佳路线。
求助
麦克阿瑟接到开会通知，认为参谋长联席会议偏袒尼米兹，便以战区离不开主帅为由，委派他的参谋长萨瑟兰全权代表他赴会。
这次会议的主要议题是盟军进入吕宋一台湾一中国大陆三角圈的战略问题。
萨瑟兰在会上全面阐述了麦克阿瑟的意见。他说：“通往吕宋的路线是战略上最好的路线，因为只有这条路线才是从西南太平洋战区打到日本最直接的路线。麦克阿瑟将军个人以及整个美国都受惠于菲律宾人，因此应当像偿还信用债务那样尽可能快地解放菲律宾，以报答含辛茹苦的菲律宾人长期以来对美国的耿耿忠心，报答他们在战争初期所作的牺牲以及他们不屈不挠地抵抗日本占领的精神。麦克阿瑟将军曾发誓一定要打回菲律宾。他认为，如果美国在拥有资源并且处于可以援助菲律宾的战略地位时不去援救忠诚的菲律宾人的话，那么美国在整个东方的威信就要受到无可挽回的损失。如果绕过菲律宾而让菲律宾人自己解放自己，那么美国将理所当然地永远无权再次得到他们的友谊。”
海军则认为台湾是一个比吕宋更好的会合地点，它既可以封住日本和荷属东印度群岛之间的瓶颈口，又可以充当踏上整个中国海岸的垫脚石。金上将赞成攻占台湾和中国大陆沿海，他直截了当地指出：“从菲律宾出发没有什么优势。”
与会的大部分高级将领都被麦克阿瑟拒绝参加会议的傲慢态度所激怒，几乎一致同意优先考虑中太平洋进攻路线，西南太平洋战区的行动应与之合作并给予必要的支持。
由于双方各执己见，会议开了几天也没有什么定论。作为权宜之计，除了让陆军和海军各行其是外，似乎没有什么良计妙策可以驾驭太平洋战争。麦克阿瑟过于自负，而就他本人在公众中与政界所受的尊重而言，他又是个强有力的人物。他不甘被置于海军将领的领导之下，而海军也拒绝把快速航空母舰交给一位陆军将领指挥。在这相持不下的情况下，尼米兹表示，不论采取哪一种方案，麦克阿瑟进攻菲律宾的计划都可照常实施，因为这将吸引和分散日军的兵力，有助于他的中太平洋攻势。
会议进行期间，尼米兹突然接到麦克阿瑟给他的一封求援电报。
原来，麦克阿瑟尽管没有回华盛顿，却召集高级参谋研究了下一步的行动。按照原计划，他在完成“车轮”计划后将沿新几内亚北海岸向西推进，第一个目标是120 英里外的汉萨湾和韦瓦克地区。但是，防守该地的日军达4 万多，强行攻击，势必要有一番苦战，代价太高不说，即使打胜了也会严重影响推进速度。
正在他考虑怎么打汉萨湾和韦瓦克地区时，他的情报人员探悉，日军欲在查亚普拉建立新防线，在那里已修建了几个机场，并派去海军修建大队扩建那里的天然良港，同时还计划向那里增派几个师的兵力。
麦克阿瑟大惊，如果日军的计划得以实现，查亚普拉无疑将成为他西进道路上的另一个腊包尔，这将极大地阻碍他早日实现重返菲律宾的宏愿。
不过，麦克阿瑟毕竟是一名杰出的军事家，一个大胆的作战计划很快在他脑海里出现：绕过汉萨湾和韦瓦克，直接扑向500 英里外的只有1．2 万日军防守的查亚普拉，以迅雷不及掩耳之势，在敌人增援部队赶来之前攻占该地区。这样不但可以阻止日军在此建立坚固的要塞，切断安达二十三中将指挥的日本第18 军的退路，而且还可以把盟军的空中轰炸线向西推进到鸟头半岛，从而使重返菲律宾的时间大大提前。
但这个计划有一个问题不好解决，即由于这一步跃得太大，超出了陆军航空队战斗机的作战半径，只有使用航空母舰上的舰载机才能解决空中支援问题。可是金凯德的舰队又没有航空母舰，唯一的办法是向尼米兹求援。
麦克阿瑟马上给尼米兹发出求援电报。他的部下担心地提醒道：“我们与尼米兹将军矛盾很深，恐怕他不会答应吧？”
麦克阿瑟果断地说：“不管这些，只要能提前重返菲律宾，我可以与任何人对话，我不在乎是否有夫什么面子，面子这种东西太束缚人。”
尼米兹接电后，想起麦克阿瑟那种趾高气扬、专横跋扈的样子，心中便不大愿答应他的要求。况且他的航母舰队还要为夺取卡维恩岛提供空中支援。同时为两个方向上的行动提供空中支援，势必会影响他在台风季节到来前完成进攻马里亚纳群岛的行动。
马歇尔也接到了麦克阿瑟发来的电报，于是找尼米兹征询意见。尼米兹谈了自己的想法。马歇尔沉思一会儿说道：“如果将军仅仅是由于不便同时为两个方向上的作战提供空中支援，而不能援助麦克阿瑟的话，可以考虑取消攻取卡维恩岛的作战行动。”他略作停顿，又解释道：“我绝没有偏袒麦克阿瑟的意思，只是他的这个计划太重要了，它能使我们以较少的代价，取得较大的胜利。”
尼米兹不否认麦克阿瑟这个计划的合理性，他承认在作战指挥上，麦克阿瑟是个天才，听完马歇尔的求情，觉得与陆军关系过僵不利于今后战区间的协调行动，于是顺水推舟地答应全力支援麦克阿瑟在查亚普拉的行动。
3 月12 日，参谋长联席会议正式下达作战命令：批准麦克阿瑟进攻查亚普拉的计划，时间是1944 年4 月15 日，届时第5 舰队将给予支援；尼米兹的部队将在6 月15 日进攻马里亚纳群岛，9 月15 日进攻帕劳群岛。11 月15日两支部队协同进攻棉兰老岛。至于攻取棉兰老岛后是进攻吕宋还是占领台湾，则留待以后再定。1945 年2 月15 日前，西南太平洋和太平洋战区的部队应作好进攻上述两地的一切准备。
麦克阿瑟得到尼米兹第5 舰队的支援，十分高兴，立即给尼米兹拍发电报表示感谢，并邀请尼米兹到他的司令部相叙。电报中说：“长期以来，我就想在这里接待您。我相信通过我们之间的商谈，两个司令部之间的紧密合作将会得到进一步加强。因此，如果您什么时候作为我的客人来到布里斯班，我将感到高兴，我保证您将受到热情接待。”
尼米兹虽对上次麦克阿瑟拒绝他的邀请，没有到珍珠港开会不满，但考虑到他的第5 舰队支援西南太平洋战区作战需要协调一些具体事宜，再者也可借此机会修补与麦克阿瑟之间的隔阂，所以决定接受邀请。
他在给麦克阿瑟的回电中说道：“今晨从华盛顿返回珍珠港，看到你盛情邀请的来电，十分感谢。我对近期能受到你的接待感到十分高兴。我相信，我们俩人间的商谈将能保证我们在下次战役中的紧密合作。在今后几天内，我将通知你我离开这里的时间。”
拍完电报，尼米兹就把第5 舰队司令斯普鲁恩斯从夸贾林岛召回，向他传达了参谋长联席会议新的作战计划。他们与太平洋舰队参谋部共同商定，对麦克阿瑟攻取查亚普拉战役分两步进行支援。4 月1 日，第58 特混舰队袭击贝劳群岛及附近的加罗林群岛内的基地；15 日，航空母舰舰队直接支援麦克阿瑟的部队登陆查亚普拉，并袭击加罗林群岛的其他日军基地。对贝劳群岛的袭击主要是掩护麦克阿瑟的部队在查亚普拉的登陆，同时也为中太平洋部队今后的进攻进行一次侦察。尼米兹担心日本联合舰队可能截击袭击贝劳群岛和加罗林群岛的第58 特混舰队，因此命斯普鲁恩斯从航空母舰舰队的掩护部队中抽出6 艘战列舰、13 艘巡洋舰和26 艘驱逐舰，加强给第58 特混舰队。
这件事情安排妥当后，尼米兹又准备了一些礼品。他派人在夏威夷找到一些珍贵的兰花，准备送给麦克阿瑟夫人；又到檀香山买了印有夏威夷文的丝织运动衫，准备送给麦克阿瑟的独生子；他还买了几盒夏威夷生产的糖果，准备送给麦克阿瑟全家。
一切准备就绪后，尼米兹便启程飞赴布里斯班。
好事多磨
布里斯班位于澳大利亚东海岸中部，四周群山环抱，东部临海，是个风景秀丽、气候宜人的港口城市。西南太平洋战区司令部从墨尔本迁出后就设在这里。
3 月25 日，尼米兹乘水上飞机到达布里斯班码头，推开舱门便看见麦克阿瑟及其他高级将领站在码头上迎接，不禁既惊讶又高兴，因为不久前连马歇尔来这里也没有受到过如此礼遇。
这是美军在太平洋战场两大战区的统帅首次会面。他们在互道问候和介绍之后，前往尼米兹的下榻之处。为表示友好，麦克阿瑟把尼米兹安排在自己往的华丽的伦农饭店，从这个饭店跨过广场就是著名的昆士兰最高法院大厦。
当晚，麦克阿瑟为尼米兹举行了盛大宴会。宴会前，尼米兹到饭店顶楼麦克阿瑟的住所，拜会了主人一家，把带来的礼物送给他们。麦克阿瑟夫妇对尼米兹赠送的兰花异常喜欢，赞不绝口，连连称谢。
次日，麦克阿瑟在自己的官邸与尼米兹举行会谈。麦克阿瑟听了尼米兹的介绍，非常同意第5 舰队关于支援查亚普拉登陆战役的方案。
尼米兹告诉麦克阿瑟说：“第58 特混舰队在贵部登陆后的第二天中午前撤离滩头阵地。”
肯尼担心地说道：“就怕那里的机场到那时还不能接收战斗机，将军把舰队撤回，会无法掩护第7 两栖作战部队的供应船只卸货。”
尼米兹笑笑说：“这个问题我已经考虑到了，我会向那里派去8 艘护卫航空母舰，它们可以留在战区8 天，为你们的运输船队提供空中掩护。”
麦克阿瑟高兴地说：“将军大力支援，实在令人兴奋，不知您有什么困难需要我们解决？”
尼米兹略作思忖后说道：“我担心大型航空母舰在查亚普拉附近遭日军空袭，据情报报告，日军在那个方向的飞机有二三百架。”
麦克呵瑟马上说道：“请将军放心，我会让肯尼将军出动P—38 远程战斗机负责航空母舰的空中掩护任务。同时，我还可以从达尔文机场调遣大批轰炸机袭击附近的日军机场。”
尼米兹了解P—38 型远程战斗机的性能，在当时那是一种先进的飞机。1941 年12 月，美国对德、意、日宣战之始，从冰岛基地起飞的P—38 型远程战斗机就在北大西洋上空击落了一架德国FW—200C 型四引擎轰炸机，从而揭开了对德作战的序幕。1943 年4 月18 日，日本海军联合舰队司令山本五十六海军大将的座机也是被P—38 型远程战斗机击落的。
尼米兹表示十分满意。他发现麦克阿瑟的确是个卓越的将才，聪明能干，富有吸引力。但同时，麦克阿瑟主观武断的性格也给他留下直接印象。
在最后一天的会议上，尼米兹根据参谋长联席会议的指示，要麦克阿瑟与他共同制定一个抄近路快速向吕宋一台湾—中国大陆三角地带推进的补充作战计划。麦克阿瑟一听就火了，因为这项指示没有明确是否先攻占菲律宾。在麦克阿瑟心中，重返菲律宾已成为一切作战计划的出发点，凡是有悖于这个目标的计划，他毫无例外地反对。他似乎忘记了前面的友好与微笑，对尼米兹大发脾气：“将军阁下不会懂得我的心情，您不了解我对菲律宾1700万人民所负有的义务是多么神圣，我不会放下菲律宾不管，永远不会！菲律宾从我的手中落在日本人手中，我要亲手把菲律宾从日本人手中夺回来！”他大声指责道，“华盛顿的那帮先生们为什么对菲律宾不感兴趣？就是因为他们不了解情况，从来没有听过枪声，却在那里炮制太平洋战争的战略，一个不切实际的战略！”
尼米兹见状，知道再谈下去也没什么益处，便不再讨论这个问题。不过，他对这次会晤仍感到满意。他回珍珠港后给金上将写了一份报告，汇报了这次会晤的情况。报告中说：“我和我的随行人员在整个访问期间，受到他真诚而周到的热情接待，没有什么可挑剔的。会议自始至终都开得很好，很顺利。”
海军和陆军的争吵总算告一段落。麦克阿瑟顺利攻占了查亚普拉岛。1944 年夏，他的部队又攻占日军在新几内亚的最后一个据点——鸟头半岛。这样，经过3 个月的努力，麦克阿瑟终于沿新儿内亚海岸建立起一系列海空军基地，回到了菲律宾的大门口。
然而，就在他踌躇满志地准备攻取菲律宾时，参谋长联席会议发来的一份密电，又使他大吃一惊。