笾塘膊啤Ｉ小⒐�2人也各有兵2万，也强征关税，聚敛钱财。三藩每年耗掉军饷2000余万两。他们的存在对清朝构成极大威胁。康熙帝决定撤销。
康熙十二年，尚可喜请归老辽东，留其子尚可信镇广东。康熙帝要求他们父子尽回辽东，并要撤藩。得知这一消息后，吴三桂、耿精忠也“要求”撤藩，以试探朝廷对他们的态度。康熙帝与议政王商议撤藩问题。很多人包括大学士图海、索额图等清政府重臣都说不宜撤，但户部尚书米思翰、兵部尚书明珠、刑部尚书莫洛同意撤。康熙帝认为吴三桂撤亦反，不撤亦反，决定三藩并撤。吴三桂原希望朝廷慰留他，让他效法沐氏世镇云南。没想到康熙帝下撤藩诏，大失所望，便谋反叛。当时朝廷派侍郎哲尔肯、翰林院学士傅达礼去云南催吴三桂办理撤藩，吴三桂便加快了反叛步伐。
这年十一月，吴三桂以谒永历帝朱由榔墓，与之告别为借口，挑起部众反清情绪，杀了催他离开云南回辽东的云南巡抚朱国治，发布反清檄文，自称天下都招讨兵马大元帅，以翌年为周元年。蓄发，易衣冠，旗帜尽白。他致书二藩、郑经与贵州、四川、湖广、陕西诸将吏，要他们响应。十二月吴三桂出兵贵阳，贵州提督李本深投降。吴三桂派马宝率军由贵州入湖广，派王屏藩进攻四川，窥视陕西。十三年正月，吴三桂称周王，改元利用，遣部将杨宝应破常德，夏国相破澧州，胡国柱破衡州，吴应麒破岳州。在吴三桂影响下，总兵、提督纷纷从叛，除李本深外还有云南提督张柱国、四川总兵谭弘、吴之茂、提督郑蛟麟、巡抚罗森，湖北襄阳总兵杨来嘉、河北总兵蔡禄、广东潮州总兵刘进忠。十三年，陕西提督王辅臣杀经略莫洛在宁羌反，并于十四年攻陷兰州、延安与绥德。耿精忠于十三年三月据福建反，囚禁福建总督范承谟，到十三年年底，已经占据浙、赣30多个城市。郑经派大将刘国轩率师进攻闽粤沿海潮州、漳州和泉州，并打到惠州府。十五年尚之信在广东叛变，囚禁忠于朝廷的父亲尚可喜。孝庄皇后养女孔四贞之夫抚蛮将军孙延龄也于十三年二月叛应吴三桂，杀都统王永年，幽禁巡抚马雄。一时间，中原、西南、东南反清甚嚣尘上。然而，当吴三桂占据湖南后便不再渡江，却派遣夏国相进犯江西以与耿精忠相合。他攻陷萍乡、上高、新昌等地。另一路是从岳州分出部分精锐，与杨来嘉一起进犯陕西，以与王辅臣相合。然而，由于清军的阻击，这个西进计划未能实现。
康熙十四年三月，蒙古察哈尔部亲王布尔尼也乘机兴兵作乱，对京师造成威胁。这支叛军为信郡王鄂札和都统大学士图海所败。
吴三桂叛变的消息首先于十二年十二月二十一日为差往贵州的党务礼、萨穆哈驰驿到京所报告。原来反对撤藩的索额图要求主张撤藩的官员正以国法。当时年仅20岁的康熙帝承担责任，坚决地说：“此出自朕意，他人何罪？”
对于吴三桂的叛变，康熙帝采取坚决打击的政策。他采取分化剿抚并用策略。他下令停撤广东、福建两藩，把打击的主要对象放在吴三桂方面。他削了吴三桂的官职，又将留在京城的吴三桂儿子吴应熊投入监狱。十三年四月读了由哲尔肯、傅达礼带回的吴三桂要求划江而治的奏章，康熙帝大怒，杀了吴应熊及其儿子吴世霖。水来土掩，兵来将挡，康熙帝向叛乱的地方和对平叛有战略意义的地方一一派出将领（主要是八旗将领）率军前往：十二年十二月令孙延龄为抚蛮将军，线国安为都统镇守广西，前锋统领硕岱扼守咽喉要地荆州，还派多罗郡王勒尔锦为宁南靖寇大将军赶赴荆州，以扼制叛军北上，派都统赫业为安西将军、西安将军瓦尔喀赴四川，扼守汉中，护军统领胡礼布为副将军，率署前锋统领穆占、副都统颜布跟随入川，令副都统马哈达驻守兖州。十三年正月，令总兵徐治都守夷陵，隆禧为镇西将军守西安，令都统巴尔布率军加强荆州守备，令都统朱满率兵守岳州，将军尼雅翰到安庆。三月清廷令安南将军额驸华善守京口，定南将军希尔根驰援江西，平寇将军根特巴鲁赴援广东。四月，以根特为平寇将军赴广西讨伐孙延龄，调西安副都统德业立守襄阳。扬威将军阿密达镇守江宁，平南将军赖塔率师赴杭州，令阿密达袭诛蔡禄。六月贝勒尚善为安远大将军率师赴岳州，康亲王杰书为奉命大将军赴浙江。九月，广西提督马雄叛变，令安亲王岳乐为定远大将军率师赴广东。康熙帝还令南怀仁赶造火炮以攻叛军。南怀仁赶造的火炮后来在进攻萍乡夏国相的叛军时发挥了作用。
康熙帝运筹帷幄之中，决胜千里之外，一系列精心的布置逐步收到效果。
浙赣福建方面。十三年三月耿精忠自福建将兵马分为三路：总兵白显忠进攻江西，总兵曾养性攻击浙江，都统马九玉从仙霞岭进攻金华、衢州。七月浙江总督李之芳协同赖塔，率满洲兵、绿营兵与乡勇败曾养性于金华、常山、石梁，收复义乌、汤溪、寿昌、淳安、东阳、嵊县。十四年正月，杰书在浙江打败耿精忠，收复永康、缙云。十二月，杰书大败曾养性于衢州与台州。十五年七月，赖塔大败马玉九、林福于衢州，又败之于仙霞关，进入福建。十四年上半年希尔根、岳乐在江西联合作战，收复龙泉、西塘、宁州、建昌、永新、庐陵。十五年二月，吴三桂派遣高大杰、韩大任袭占军事重镇吉安。岳乐力复萍乡。十六年三月简亲王奉康熙帝令围攻吉安，高大杰病死，韩大任投降。福建方面。八月，根据李之芳建言，杰书攻占具有战略意义的仙霞岭，马九玉投降。九月清军收复建宁、延平。马、白已先后投降，十月耿精忠只好投降。曾养性后来也投了降。十六年，郑经军在兴化、泉州一带为清军击败，退出漳州。十九年郑军退回台湾，清军复取厦门、海澄、金门。浙江、江西、福建于是平定。
川陕甘方面。王辅臣叛乱后，康熙帝依甘肃巡抚华善之请，授予提督张勇靖逆将军，并予以便宜行事权。张勇麾下有西宁总兵王进宝、甘肃总兵孙思克、宁夏总兵陈福。陈福在宁夏兵变中被杀，张勇疏荐天津总兵赵良栋任宁夏提督。十五年二月，图海被任命为抚远大将军平定王辅臣的叛乱。三月，吴三桂派王屏藩、吴之茂从四川北上，声援王辅臣，为张勇、王进宝与振武将军佛尼埒击败。四月围困兰州，五月，图海在王进宝与凉州提督孙思克协助下败王辅臣于平凉城虎山墩，康熙帝给王辅臣发去招降谕旨，王辅臣接受招抚投降（诏复其官，授靖寇将军。接进京令后自杀）。六月守将赵士升投降。张勇复河、洮二州。十五年，赵良栋与王进宝分兵平定了秦州西和、礼县。十八年十月，赵良栋克徽县，进而克略阳、阳平关、沔县。十九年复成都，以功擢云贵总督，加兵部尚书。十五年擢为陕西提督的王进宝于十九年收复凤县、两当，复汉中地，十九年克保宁。王屏藩自缢，吴之茂与部将共17人被擒而杀之。昭化、剑州、苍溪、蓬州、广安、合州、西充、岳池皆定。
两广方面。十三年二月孙延龄叛应吴三桂，广西提督马雄初不从叛，后来也叛。广西巡抚傅宏烈为图恢复，阳受吴三桂伪职。他曾劝说孙延龄反正，并于交址界募义兵5000人，克桂林、玉林、梧州、昭平、浔州千余里。十八年正月，他与镇南将军莽依图率军在南宁彻底击溃吴军。十九年二月后为马雄子马承荫军欺骗被执，送往吴世Тρ衬选Ｊ晔滤镅恿浞蚋敬蛩憬登澹馐犁薄Ｊ晔辉拢锌上泊巫由兄⒙示氤敝荩靼芰踅遥顺敝荨⒑３巍Ｉ兄诺貌坏轿馊鹦湃危滴醯哿疃运敖怠Ｊ迥晔律兄磐督怠？滴醯哿罡雌渚粑唬娲缶址ヅ丫！ �
湖南方面。吴三桂打到长江南岸松滋后不马上北上，停留了3个月，为的是等康熙帝对他隔江而治建议的答复。这是他的最大失策，给了康熙帝调兵遣将时间。八旗军到达荆州不敢过江与吴军作战。吴三桂兵力主要集中在岳州，但由于大批人马调往江西以联合耿精忠，又有部分调往西北以与王辅臣相合，岳州、长沙比较空虚。十五年三月，岳乐进攻长沙，尚善进攻岳州。经过激战，两军形成对峙。十六年征南将军穆占征讨湖南，与岳乐猛攻长沙。十七年初清军占领湖南东南数县。越来越感到困难的吴三桂欲以称帝振奋叛军。于是三月草草成礼，称帝衡州，国号为周，大封群臣。然而八月即去世。孙吴世Ъ吹畚唬脑榛ㄍ笱簟Ｆ咴挛饩凸ビ佬耍嗽乱蛭馊鹬蓝纷摺Ｊ吣耆蛉拢馑炝中酥榉凑Ｋ撞叨系粑庥璧牧傅乐撸四暾拢寰崭丛乐荩幼攀崭闯ど常率崭春庵荨Ｊ拍耆拢庥琛⒑映街萏油笱簟！ �
二十年，清兵分别由贝子彰泰、赖塔、赵良栋统领，由粤、湘、蜀进攻吴三桂老巢——云南，二月吴世ё陨保兹刖馊鸨痪蚍匚龉恰３ご�8年之久的三藩之乱终于结束。
平定三藩过程中，以前驰骋沙场一往无前的八旗兵已现出畏葸不前的暮气。图海、赖塔、穆占这些八旗将领还能敢打敢拼，战绩突出，而勒尔锦、尚善、喇布则畏敌如虎。勒尔锦、尚善抵达荆州三年都不敢过江，仅作壁上观。勒尔锦被革去郡王，羁禁，尚善革去贝勒，喇布统兵数万，竟多次败于仅有4000兵的高大节，被召还京师。相反，绿营却表现出勇猛顽强的气势。康熙帝及时地鼓舞绿营。康熙十五年五月，令兵部查明功次，及时议叙。起巨大作用的绿营将领除西北的张勇、赵良栋外，湖北地区的有蔡毓荣、万正色、徐治都，浙江有施琅、姚启圣、吴兴祚，广西有傅弘烈等。绿营共有40万投入战斗，在关键时刻起了作用。攻打云贵时，“绿营步兵居前，旗兵继之，所向皆捷”。
三藩平定巩固了清朝对全国的统治，为尔后开展行政和财政改革，驱逐沙俄在黑龙江的侵略势力，解决西北边疆问题，开拓疆土奠定了基础。
施琅取台湾
康熙二十二年（1683）康熙帝以施琅为水师提督，攻取台湾，完成了台湾与大陆之间的政治统一大业。
施琅（1621…1696）福建晋江人。初为明总兵郑芝龙左冲锋，顺治三年降清。郑成功招施琅不至，郑成功将他父亲、弟弟及子侄都给杀了。
台湾自古是中国土地，明末为荷兰殖民主义者霸占。为了建立抗清复明根据地，顺治十八年三月郑成功进攻台湾，赶走荷兰殖民主义者，收复了台湾。康熙元年五月，郑成功病逝。郑成功死前，长子郑经在厦门，与乳母通，产下一子，郑成功知道后很生气，令人把郑经杀了，诸将保护郑经没杀。台湾黄昭、萧拱宸伪造郑成功遗诏拥立郑经弟郑世袭为护理国事。讣至厦门，郑经承袭“延平王”爵位。他以全斌为右军都督，陈永华为谘议参军，冯锡范为侍卫，准备东渡台湾（讨伐郑世袭等人）。这时清靖南王耿继茂、闽浙总督李率泰派人来劝降。郑经表示愿效法朝鲜，做属国，进贡。清朝方面当然不同意。冬十月，郑经赴台，捕获郑世袭、黄昭、萧拱宸等人。
陈永华善治国，在他的辅佐下郑经铲除荷兰在台湾的殖民主义势力，开展经济文化建设，大力垦殖，种蔗制糖，又与英国、菲律宾群岛开展贸易。
十七年十月，金门、厦门为耿继茂、李率泰与施琅、黄梧所取。清军“堕两城，弃其地，收宝货妇女而还”。金门、厦门失守后郑经加强了澎湖的防卫，在妈宫港建垒，筑炮台。十八年荷兰将领波尔德与清军合攻台湾，因台湾固守，率舟北上，到普陀山，遇飓风覆没。
从十九年起，施琅就开始疏请攻台。掌管台湾军事的大将刘国轩知道施琅意图，在澎湖沿岸筑短墙，置腰铳，建起壁垒（围墙）二十多里。此时三藩尚未平定，康熙帝当然还不能马上实施这一方案。二十年正月郑经病死，十月三藩平定，郑经死后，台湾内讧。本来在郑经应吴三桂约出兵闽粤期间，台湾政事委任于长子郑克。郑克贤明，有治才。7年后郑经回到台湾也还是由郑克管理政事。郑经死后应该由他主政。但部将刘国轩、冯锡范擅权，杀了郑克，而立只有12岁的郑经幼子郑克塽。这时，解决台湾问题提到康熙的议事日程。二十年七月，康熙以施琅为水师提督。福建总督姚启圣对于攻台也很积极。施琅似乎更积极。到二十一年十月，他先后四次请求专征。议政大臣会议支持他，大学士明珠支持他，康熙帝也答应了他的请求，并指示施琅相机进剿。此外康熙要求姚启圣在钱粮方面大力支持。十一月姚启圣给施琅解到银9万两，另外提供了25000两用于奖赏。
六月的澎湖风急浪高，不是用兵时候，但施琅就是要打个敌人意料之外的仗。二十二年六月早晨，施琅率领2万余水军，二百三十只船集结铜山。蓝理自告奋勇充当前锋。次日申时（下午三时到五时）施琅率军乘风破浪抵达澎湖西南的猫屿和花屿海面，即取八罩屿与锚泊地。刘国轩以为他已在澎湖沿岸设了那么坚固的防御工事，现在又是八罩屿大风大浪季节，施琅无论如何也不可能在八罩屿停舟。郑军将领要求乘清军立足未稳的时候先发制人，刘国轩不同意。他要以逸待劳，不战而收全功。
十六日施琅率军进攻澎湖。蓝理率领7条舰船冲入敌阵。大风冲散了蓝理船只，郑军舰船合围过来。施琅指挥舰船救援。流铳射中施琅眼睛，仆倒。蓝理去救，腹被大炮打中，肠都出来了。郑军将领曾瑞大喊：“蓝理死矣！”蓝理扶着弟弟起身，大呼：“蓝理在，曾瑞死矣！”众皆感奋，奋勇向前。郑军将领林升身中三箭，郑军混乱。施琅引军而还。施琅奖励蓝理2000两。
十七日施琅用甲衣裹头，集中将士分兵四路，再次进攻。蓝理要求上战场，施琅坚决要他留下。施琅严申军令，总兵以下退缩的斩首。刘国轩率领船二百余艘，官兵二万列阵以待。两军海战开始，烟火蔽日，呼声震天。开始时风朝清军吹来，海浪大起，但施琅坚持战斗，呼天相佑。随后风向反转，施琅令火器船进攻，火桶、火罐扔向郑军，郑军大败。清军伤亡二千一百多人，总兵朱天贵战死，总兵林贤重伤，而郑军被击毙万二千人，将领邱辉、江胜、陈起明、吴潜、王隆等战死，烧毁战舰二百多艘。刘国轩逃往台湾。
康熙得知澎湖的胜利消息十分高兴，要求给予施琅足够的援助。施琅把兵剿与招抚结合起来。为降兵医疗，厚待刘国轩亲信，全部让他们回台湾，叫他们给刘国轩捎信：如果投降，一定保奏，封给公侯。
台湾人心鼎沸。郑克塽令文武商量对策。建威中镇黄良骥主张取吕宋（菲律宾），冯锡范同意，但刘国轩认为不行，坚决主张投降。闰六月初八，郑克塽让协理礼官郑英平、宾客司林维荣持降表到澎湖见施琅，请求允许世守台湾，受到拒绝。郑克塽不得已派冯锡圭等再到施琅跟前，表示彻底投降，交出延平王印、武平侯刘国轩印、忠诚侯冯锡范印，又派遣刘国昌、冯锡奎到施琅军前，缴奏版籍土地人民。这时康熙降敕也到达澎湖。内容大意是郑氏集团如果投降，他们过去的罪