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同样愤怒、甚至更愤怒的还有武昭仪，她这时就藏在高宗身后的帘中。听到禇遂良如此嚣张大胆的言论，她的怒火再也控制不住，竟忘了自己身在何处，大声地尖叫了起来：“何不扑杀此獠！”
事件的整个过程如此迅速如此激烈，令观者不及掩耳。于志宁吓得连话都不敢说，长孙无忌也只能勉强出头：“遂良受先朝顾命，有罪不可加刑！”总算阻止了高宗颁下“扑杀”的旨意。
消息立即传出，举朝惊骇。长孙无忌的姻亲韩瑗随即进谏。高宗不肯接纳。韩瑗不甘心，第二天又谏，而且当场涕泪交流悲不自胜。孰知高宗毫不在乎他的眼泪，干脆命人将韩瑗拖出殿去。韩瑗只得书面进谏：“昔吴王不用子胥之言而麋鹿游于姑苏。臣恐海内失望，棘荆生于阙庭，宗庙不血食，期有日矣！”来济也跟着上书：“孝成纵欲，以婢为后，使皇统亡绝，社稷倾沦。有周之隆既如彼，大汉之祸又如此，惟陛下详察！”
毫无疑问，这些老家伙的进谏对于高宗来说，不但不入耳，更极端刺耳。不但起不了作用，反效果倒是越来越显著了。
李治当年能正位储君，长孙无忌之力最大。以至于太宗宣布立储之后竟对李治说：“汝舅许汝矣，宜拜谢。”后来太宗去世，李治也首先抱着舅舅的脖子嚎啕大哭；此后整个永徽年间的政事，也基本都在长孙无忌的安排下进行。只是这原本非常和谐的画面随着时间的推移变了味。长大的李治不能忍受舅父的耳提面命，急不可耐地渴望当“真皇帝”，长孙无忌却始终掂记着自己的扶立之功，他的盟友们也不例外，只要逮着机会就要提醒李治“先帝顾命”之类的东东。他们都忘记了一件事：“先帝”已经死了，眼前的这个青年才是他们的现实主宰。做为皇帝，李治只愿意承认自己是太宗嫡子，理所应当继位；而不是每天听人提醒“你的皇位是别人帮你弄来的”。
然而易后遭到这么多重臣的反对，高宗也不能不顾忌，这时的他急需在重臣中找到自己的支持者。他想到了一直都沉默的司空李勣。
李勣的立场很明确，何况长孙无忌曾经借高阳公主谋反案杀掉了他的多名军中同僚，因此他根本不打算帮长孙无忌淌这趟混水：“此陛下家事，何必更问外人！”对高宗来说，掌握军权的李勣如此表态，简直是从天而降的好消息，只要军队肯支持自己，还怕长孙无忌一派翻出什么大浪来？他当即下定了与顾命文臣彻底决裂的废后决心。
与此同时，许敬宗在朝臣中宣言曰：“农夫多收了十斛麦，尚欲易妇，况天子欲立一后，何豫诸人事而妄生异议乎！”这番话虽然粗俗无礼，却也是另一种表态，高宗更要大干一场了。
于是，禇遂良“还陛下笏”的愿望得到了实现：这位顾命大臣被贬为潭州都督，远去湖南了。
禇遂良被贬的第二个月，即永徽六年十月。这个月份对于武昭仪来说，是一个大吉大利的月份。本月十三日，高宗颁下了一道冰冷无情的旨意：“王皇后、萧淑妃谋行鸩毒，废为庶人，母及兄弟，并除名，流岭南。”谁也不知道，王皇后与萧淑妃“谋行鸩毒”这样不可思议的事情是怎么能发生得了的？但是皇帝的旨意谁也不敢质疑。
十九日，另一道匠心独运的圣旨公布：“武氏门著勋庸，地华缨黻，往以才行选入后庭，誉重椒闱，德光兰掖。朕昔在储贰，特荷先慈，常得待从，弗离朝夕，宫壸之内，恒自饬躬，嫔嫱之间，未尝迕目，圣情鉴悉，每垂赏叹，遂以武氏赐朕，事同政君，可立为皇后。”一句“事同政君”，轻飘飘地翻过了武媚出自太宗后宫的记录。不管世人如何讪笑，他们也只能仰望着三十二岁的武媚登上富贵的巅峰、只能弯起他们自命高贵的膝盖向她叩拜如仪。
大获全胜的武媚很愿意做出母仪姿态，就在册后大赦的当天，她向高宗上表：“陛下前以妾为宸妃，韩瑗、来济面折庭争，此既事之极难，岂非深情为国！乞加褒赏。”高宗意味深长地将这道表章拿给韩瑗来济观看，而韩瑗与来济也都看懂了：正共同品尝胜利的帝后此时是何等亲密，武皇后的表章该是怎样泡制出来的？这与其说是新皇后在故示大度，不如说她已经和高宗一起开始了秋后算帐和新的宣战，只是这次帝后齐心，与群相的争斗也不再如从前那般辛苦，而是完全地猫玩老鼠、从容不迫。可想而知，韩瑗和来济忧惧不已，屡屡请求辞职。而高宗怎么会允许老鼠提前逃走？回应当然是“不许”。
对于历尽辛苦才取得的成果，李治与武媚决定将这场册后典礼大加操办，誓要吐气扬眉，给曾经藐视君威的顾命老臣们看看。在这样的情形下，永徽六年十一月一日为武媚举行的立后大典异常隆重。这一天，司空李勣继二十年前为武士彟主持丧礼之后，又和于志宁一起成了为武士彟之女奉玺绶的册后使。是日，百官及四夷酋长、各邦蕃使并诸内外命妇齐朝武皇后于肃仪门，开朝拜皇后的先河。
当大唐王朝所有曾经高贵的头颅都低下、所有曾经尊贵的膝盖都在皇权君威的逼迫下跪倒、向他们曾经百般诅咒过的女人俯首称臣的时候，肃仪门上的武皇后、还有一手安排这出典礼的高宗李治心里该有多么踌躇满志？这场典礼使皇帝皇后的胜利更显辉煌，也让顾命大臣们的失败显得更为惨痛。
为心爱女人举行了盛大典礼的李治似乎忽然有了新旧对比的念头，他又想起了王皇后与萧淑妃，何况他自己也知道，王萧二人实在也罪不至此，那道宣称二人欲行鸩毒的诏书多份是自己的加油添酱，于是典礼后的某一天，他信步走进了囚禁昔日枕边人的别院。颁布旨意和身临其境毕竟还是不同的，院落中凄凉的场面引起了他的“恻隐之心”。已经身陷泥潭的王废后此时做了任何一个人都会做的事情，哀求高宗能够改善自己的待遇，祈盼这个已经在大节上薄倖了的男人多少还能剩些许怜惜之情。而高宗也被那场面感动，许了个愿。
这场会面的消息很快就传到了武皇后那里，她的怒火可想而知：皇帝是个一头水，皇后的废立也只在他的一道诏书间，一但在这个节骨眼上松了劲，自己这个皇后也就死到临头了。而高宗一但面对武皇后，头脑也随之清醒：与顾命大臣们翻脸并成功上位，靠的就是在废后事宜上寻到的岔子，如今顾命大臣还未全数倒台，就改善废后的待遇旧情复燃，翻脸就显得太没有说服力了。只有绝不宽恕王皇后萧淑妃，才能进一步对顾命大臣们追魂索命，稳固自己好不容易才夺回的君权。如此一想，刚才催人泪下的场面在李治心里就变得毫无意义了。李治和武皇后再一次达成了共识，随之而来的，却是王皇后萧淑妃的万劫不复：在武皇后的催促下，李治颁下了处死王萧二人的敕书。
自从李治走出小院，王皇后与萧淑妃就一心盼望着他的“处置”，可她们无论如何也没有想到，苦苦盼望来的，竟是这样一道催命符。人生至此，夫复何言？既然哀求也保全不了性命，那就在生命的尽头保有最后一丝尊严。王皇后照礼仪镇静地“拜谢”了丈夫的“恩赐”：“陛下万年！昭仪承恩，死吾份也！”而萧淑妃则不然，正如人所说：正常的女人无论怎么能够坦然面对自己和父母家属的悲惨，也无法接受亲生儿女的悲惨命运。想到三个儿女将要遭受变心丈夫和情敌的摧残，萧淑妃破口大骂：“武氏狐媚，翻覆至此！我来世为猫，使武氏为鼠，吾当扼其喉以报。”
无论是镇静还是失态大骂，可怜的王皇后萧淑妃当然是死定了。然而对于她们是怎样死的，说法却不一。旧唐书说她们是被“缢杀”的，新唐书却说她们每人先被打了百杖，然后又“剔其手足，反接投酿甕中”，然后“数日死，殊其尸。”这还不算完，身死之后，王氏被改姓蟒氏，萧氏被改姓枭氏，随后，二人的家族带着耻辱的姓氏被流放岭外。
若照新唐书的说法，武皇后的手段实在是太可怕了。可怕并不仅仅止于赐死流放，而是过程的残忍。这似乎可以说是她多年积怨的一次大爆发：兄弟的轻辱、太宗朝的枯寂、尼庵的惶恐、女儿的死、在整个争夺后位过程中反反复复被揭的伤疤（事父子二人、出身非士族大家）……都发作了出来。在这方面表现得最明显的一点，并不是王萧二人惨死的方式，而是别出心裁地要改掉她们出身的两个士族巨室的姓氏。很明显，情敌和政敌们攻击她的经历出身，她就要让对手们与他们引以为荣的骄傲之源——姓氏，彻底脱离。“我拥有不了的，就要让你们也得不到。”从肉体上消灭对手又算什么呢！
经过这一次改姓流配及其后陆续有来的折磨，王、萧、柳等曾经傲视同侪的清流大姓遭到了几乎毁灭性的打击。
仅以王皇后的母亲柳氏家族为例。在高宗永徽年间，柳氏家族以柳姡祝本庸偕惺槭〉某恕Ｈ欢谡庖淮瘟髋渲螅颖背岳淳统て凇俺溆谑肥希老嘀睾睢钡暮佣罩琢霞易澹宦渲劣诩竦夭剑淙晃湓蛱焖篮笏翘映錾欤堑拿乓裉厝ㄈ丛僖参薹ㄖ卣瘛Ｋ淙蝗杂小笆苛质⒆濉钡木捎笕嗽谑送旧先创哟酥荒芟笱俺Ｐ〉刂魅思页錾淼墓倮裟茄拥撞愕男±糇銎穑涂嗬湍妹マ撸捕嗍荒芑煸谄甙司偶兜男」僦吧洗蜃Ａ虾笕肆谠颂鞠ⅲ骸霸庵钗洌怨仕ズ摹Ｎ涫习埽滩荒苄恕！�
对于重视门阀胜于性命的士族来说，王皇后萧淑妃的惨死比之这样的流祸后人羞辱门第，似乎已经算不得最大的悲哀了。
说到史书上对王萧二人惨死方式的记载，似乎也有值得商榷的地方。再怎样的怨毒报复都可以想象，她就算再怎么虐待王萧二人都可能发生，但史书上所记载的方式却有些蹊跷：用啥不行，非要在大唐后宫重演吕雉对戚懿式的的戏码？当时武皇后其实地位并未稳固，死敌都未挖除，高宗又甚是粘糊，儿子也未正位储君，她正是需要继续做姿态的时候，居然就会那么勇敢地直接让大家把自己等同于吕雉了？更仿佛是提前知道自己未来将和吕雉一样，在史书上单独占有一章本纪一样。
武皇后妒恨交加下，擅改旨意杖毙甚至侮辱她们惨死都是有可能的，但是截去手足丢入酒瓮的事情却有些奇怪。讲到这个，就忍不住想起吕雉和慈禧。吕雉是唯一一个能够证实做过此类事情的女人，因为她的成就是把儿子吓病了。但武则天和慈禧都不太说得过去。尤其慈禧是绝不可能做出这种事的——因为传说被她截去手足装入酒瓮的丽妃，一直活得很不错，慈禧在做了太后之后，一直将丽妃封到皇贵太妃的名份，丽妃的女儿甚至是慈禧以嫡出公主的待遇出嫁的。似乎有些人总是喜欢让自己有成见的女性历史人物做同样的事情，这倒是另一种值得关注的心态。
另外说到萧淑妃咒武皇后为鼠自己为猫，以致于“由此宫中不畜猫”，并说武后“数见王、萧为祟，被发沥血如死时状。后徙居蓬莱宫，复见之，故多在洛阳，终身不归长安。”也显得矛盾重重。因为史书还记了另一件事，说老年的武则天闲来无事，以调教猫儿为乐，最后竟训得猫能与鹦鹉共处。武则天非常欢喜，将一对宠物带出来给百官看，显示自己的另类本领。结果在众官马屁声中忘了喂猫的时间，耐心早已在百官传观中消磨殆尽的猫儿饥火中烧，当场把鹦鹉抓来吃了。于是“太后甚惭”，猫鸟共舞就此草草收场。
至于为避王萧二人冤魂就避居洛阳，也靠不住。高宗年间，没事就往长安城以外跑的是李治本人，永徽年间去年最多的是宝鸡万年宫，显庆二年以后置洛阳为东都，称洛阳与长安是他的“东西二宅”，这才时常开始往来于长安洛阳之间。武则天做为皇后只是随行，何况她为了紧跟高宗还不得不放任儿子留在长安监国，以至逐渐造成大权旁落母子反目。区区两个冤魂与权力又孰轻孰重？再往后她改李唐为武周，要换个京城当然也是无可厚非，似乎都与冤魂扯不上关系。何况洛阳宫城中武则天杀的冤魂也够多的了，哪有老年人不怕冤魂壮年人反倒怕成这样的道理。——因此，与其说她是因为两个冤魂而避开长安，还不如说她是因为太宗年间的过去而多少有些不喜欢长安。这个道理也放在李治身上也一样可以解释得通。
王皇后和萧淑妃都灰飞烟灭了。接下来的事情也就顺理成章。
显应元年正月初六，王皇后的养子太子李忠被废为梁王、梁州刺史，武皇后四岁的长子李弘成为大唐储君。当年李忠被册太子，长孙无忌出了大力，假如王皇后不被废、假如李忠能顺利继位，长孙无忌无疑将能在扶保太宗、扶保高宗之后，成为三度扶立皇帝的大功臣。这也是他竭力阻止有亲生儿子的武媚正位中宫的暗箱理由。然而这个美好的前景，至此彻底破灭。
二月十七日，在武媚册后时已经被追封为司空的武士彟又被再次追封为司徒、周国公。
三月十七日，武皇后祀先蚕于北郊。
四月十四日，高宗偕武皇后登安福门城楼，观玄奘迎御制并书慈恩寺碑文，这场典仪上的仪仗徒从之盛，是自魏晋以来佛事中从未有过的。
大慈恩寺位于长安宫城，是李治做太子时就发愿为母亲长孙皇后兴建的寺院。这道御制碑文则完整地记述了建寺的过程之盛。从表面看来，关于这道碑文入寺的整个过程都显得慈悲不已，一片祥和，事实上却已经显出了长孙家族的末路气象——除了碑文制成当天，由长孙无忌向衮衮诸公宣读了一趟之外，其它的出头露面机会都由新贵薛元超、李义府、许敬宗给占了去。当长孙无忌站在台上做一部读稿机，念着高宗感怀母恩的字句、回忆小外甥发愿建寺时的温驯听话，想到曾经的权倾朝野，体味现实中长孙家族的处境，这可真是绝顶的讽刺，长孙无忌又该有一种怎样的悲凉。长孙皇后一生最大的愿望，就是哥哥能远离权柄，使长孙家族能够绵延长远，如今看来，是将要成为泡影的了。高宗之所以还没有立即动手，只不过是因为长孙无忌入主中枢三十余年，枝繁叶茂，刨坑断根的工作需要时日而已。
而此时，站在安福门城楼上的武皇后腹中已经怀上了她的第三个儿子，这一切都显示着李治对武皇后的宠恋殊深。照常理推测，所有的人都认为，如今皇宠隆重的武皇后家族，将要取长孙氏而代之了。然而武皇后却并不着急。
九月十二日，武后制《外戚诫》献于高宗。彰显自己并不在乎提拔外戚的意思之余，话里话外似乎也敲打着长孙家族。
同年，十一月初五，武皇后生下了她的第四个孩子：三子李显。
这时候，高宗对新晋信臣的宠任已经到了极端的程度。洛州女子淳于氏有美色，却是个杀夫疑犯，由于案情重大被送押大理寺。可是正所谓没有最猛，只有更猛，李义府居然毫不在乎淳于氏的光荣历史而看上了她，硬让大理寺丞毕正义直接送进自己府里纳之为妾。这事被大理卿段宝玄一本奏上朝廷，高宗稀奇之下命人调查。李义府怕事情闹大，为了封口硬是逼着堂堂四品官毕正义上吊自杀。这样一桩奇案，高宗居然在“知之”后，满不在乎地“不问”了。
这样的枉法纵容，当然是因为李义府是个得力的助手，正所谓人有人路蛇有蛇道，敢�