1862年初，张乐行部捻军与其他分支捻军重新会合于淮北的颍上。此时，首鼠两端的苗沛霖为报私仇攻打清政府治下的寿州，暗中与捻军、太平军相联系，支持联军进攻颍州。
但颍州的清朝守军顽强，加上城坚墙厚，捻军、太平军联军一时不能攻克。
清廷着慌，严命河南巡抚郑元善、安徽巡抚李续宜配合胜保作战，步步紧逼。
苗沛霖见势不妙（尤其是李续宜的“楚军”最让他心寒），临阵变卦，在胜保召唤下转戈杀向捻军。
太平军、捻军不敌，只能弃颍州不攻，退往颍上。
清军与苗沛霖联手，攻克颍上，杀掉不少捻军。淮北捻军星散，不少人向清军投降。
但是，张宗禹所率捻军一路攻杀，后与西北太平军会合，一直打到西安东南的尹家卫，把清军打得连连败退。同时，陕西回乱趁机愈演愈烈，引起无数血腥仇杀。
由于庐州报急文书传来，陈玉成为苗沛霖所骗，弃该州不守，贸然进入寿州，被苗沛霖诱捕，送与胜保处杀害。
西北太平军与捻军攻潼关、泌阳、南阳等地皆不克，想回援天京。由于清军处处拦阻，这些人回援不果。
由于陈玉成被俘后太平军散溃，僧格林沁等清朝将领率各部向安徽集中。
捻军各部各自为战，最终被清军各个攻破，非死即降。
1863年3月，清军把捻军压迫于雉河一带。
张乐行本想逃逸，其妻鼓励说：“好盟主，你拥众百万不敢一战，有何面目立于世间！”
经此一激，张乐行集众二十余万，在雉河与僧格林沁等部清军决战。
结果，捻军大溃。逃跑途中，蒙城西阳集的捻军小头目李家英把张大盟主当成“礼物”献给了僧格林沁。
1863年4月5日，张乐行与其二子（一人为义子）在亳州义门集受凌迟而死。
据《耕余琐闻》记述，清军把张乐行剥光衣服绑于木桩之上，活剐了一个时辰。
每割张乐行一片肉，刽子手即抛向空中。遍体如鳞割之下，只留头面未割以作传首示众用。血肉淋漓、口吐白沫之际，这位大捻首仍能张眼细看刽子手在自己身上“干活”。
《耕余琐闻》的作者慨叹：“（张乐行）痛苦若不知，贼心之不易，即死如此。”
电光飞火走游龙（6）
这位张爷活得也累，在世时多次反反复复，一会儿造反，一会投降，一会帮太平军，一会联合苗练，最终落个粉身碎骨的下场。而他老婆杜氏，也在狱中坐木驴而死。
中国第一历史档案馆藏有一份《张乐行口述》抄件，是清朝文吏记载的张乐行口供，从中可以看出他早期劫掠为王的供述，但他在口述中称自己的“女人”为马氏，不是杜氏，有可能是他军中宠幸的另一个女人。清吏为示蔑视，故意把张乐行写成“张落刑”，把他哥哥张敏行写成“张泯刑”，除此以外，口供的真实性很大：
张落刑（乐行）供：（我）年五十三岁，系亳州正东、雉河集北、张家老家人，离城一百里。家有胞兄张泯刑（敏行），女人马氏，生有一子儿，又有义子王碗儿，年均十四岁。我自来耕种为生，也曾包送过私盐。于咸丰元、二年上，我们邀人与河南永城、商邱一带老牛会打仗，互相仇杀，才聚有多人。到三年粤匪（太平军）窜扰亳境，州城失守后，各乡土匪肆起，我才与龚瞎子、王冠三、苏添幅、韩朗子各竖旗帜，大家掳抢为生。我竖的是黄旗，自称大汉永王。
五年间，颍州陆知府奉袁大人所派，带领乡团来到庙儿集攻剿我们。不久陆知府即将乡团撤退，我们人数愈众，遂纠邀上河南打商邱县的马牧集。回来于九月十七日就围亳州，先后十三昼夜，因官兵防守严紧，未能打破。旋听得河南官兵攻剿我们雉河集一带老家，遂撤回救应，不料未及赶上，被官兵将老家焚毁。七年间，我带人上怀远县城占住数月。到八年间，因粮食尽了，遂过定远县去投了广西的长发，经他封我成天义之职，授我印信札文。住了数年，我因他们待人不好，就折回老家居住。十一年十二月内，英王四眼狗队下的马永和来邀我们去围颍州府城，我与江台灵都去的。同治元年三月内官兵来到，我们才解围退回亳境尹家沟地方。
现经大兵攻剿，我们屡次打了败仗，抵敌不住，才带人往南逃跑。又被官兵追击，我的人都散了，才往东北逃回到蒙城县界西阳集，就被拿住送营。
至这几年内，各处打粮掳抢过的地方，我也记不清。我的女人马氏，现在被官兵追散，不知去向。我所生的儿子儿，并义子王碗儿，现均同我被擒送营。我胞兄张泯刑（敏行）带了数千人往西南一带逃跑，不知去向。至龚瞎子、苏添幅、王冠三、韩朗子们均先后在各处被官兵打死了。所供是实。
绝地逢生最后狂
雉河集失陷，张乐行死，但张宗禹、任化邦等人均得以突围逃走。
张宗禹等人窜入湖北，转安徽，四处游闯。然后，有数部散捻合军，大家一起进入山东。
苗沛霖因怨恨清廷裁撤其军队，忽然造反，最终被僧格林沁在蒙城消灭，其本人被杀，宗族被夷。解决苗沛霖部后，僧格林沁再下西阳集，基本平灭了淮北的捻军。
由于天京方面被围日久，洪秀全多次下旨调西北太平军回援。1864年2月，扶王陈得才、遵王赖文光等人迅速往回奔，在湖北、河南拢集了不少捻军余部，共同作战，与围追堵截的清军死拼。忙乎大半年，他们回援天京目的未达到。行至霍山，忽然有十几万太平军、捻军在不少将领带头下向僧格林沁等清将投降。
见事不可为，扶王陈得才在安徽霍山只能自杀来寻解脱。至此，西北太平军画上了句号。
赖文光跑脱后，他招集捻军、太平军残部，重组“新捻军”。名义上赖文光成为新捻军的领导人物，但由于他是太平军出身，形式大于内容，捻军旧部并不十分听从他的指挥。
“新捻军”此后又辉煌了一阵，但完全变成李自成那样的“流贼”，打一枪换一个地方，他们主要以奔驰游走和马队的机动性制胜，在河南、山东、江苏等地流行驰骋。
1865年3月，疲于奔命总想毕其功于一役的僧格林沁在山东高楼寨中了埋伏。新捻军围歼了僧格林沁的马队数千名。赫赫大名的僧王，逃跑途中受伤坠马，被捻军一个娃娃兵剁死在田埂上。
电光飞火走游龙（7）
僧格林沁之死，于清廷而言是个不可弥补的损失。从此之后，满蒙贵族中再无什么人可以独当一面，清廷只能依赖汉人势力。
僧王死后，清廷派曾国藩来对付捻军。此时的曾老，德高望重，威名赫赫，但他昔日手下的二十多万湘军尽被裁撤（为了韬光养晦，他自己主动要求裁撤的），手下可用的只有数千子弟兵，其余的，除李鸿章的淮勇外，皆是旗色不等的杂牌军。
眼见捻军各部东驰西奔在安徽、河南、山东等地窜扰，曾爷精疲力竭下，只得采用“聚兵防河”计划来谋略困围捻军。可惜，好运气不久长，曾国藩防河计划失败，清军的沙河、贾鲁河防线相继被捻军突破，最终老曾灰溜溜而去。清廷转派李鸿章专门剿捻。
曾国藩晚年的威名，除“天津教案”外，另外栽跟头最大的就是剿捻的失败。
突围过河后，捻军内部矛盾又起。昔日的太平军部与捻军不和，互相争强斗势。为了避免火拼，赖文光、任化邦等人留在中原地区，史称“东捻军”；张宗禹率部向西北进发，想联合当地造反的回民一起谋救重起，史称“西捻军”。
东捻军数万人自河南中牟出发，突入山东，准备进入运河以东地区抢粮。由于清军有备，进攻受挫，东捻军只得趋至河南商丘。他们打归德不下，复想去陕西与西捻军会合。清军非常重视，处处堵截。
跑来跑去，东捻军在1866年年底进入湖北。赖文光的想法本来很不错，他想进入湖北后抢粮休整后从宜昌杀入四川，然后以天府之地为中心，逐步四扩，力图把势力延及湖北、云南、贵州、陕西，最终与西北的西捻军和造反回民者遥相呼应，重整太平天国。
这种意图，清廷方面早有察觉。左宗棠等人密切注视东捻和西捻的动向，随时加以防范。
由于马队前行需要一定的地利条件，东捻军后来取消入陕计划，最终被迫进入胶东地区。事实证明，跑入这种地方，处处兜绕，长久而疲，虽然取得一些胜果，但东捻军在窄狭的地区根本不能发挥所长。
1868年（同治七年）1月6日，连败之下，仓惶逃跑的赖文光率残部在从仙女镇跑入扬州东北的运河边上被清军前堵后截，人马死伤大半，最后受伤被俘。
这位太平天国的遵王在生命最后关头异常冷静，供述中语气慷慨，没有任何求饶乞命的说词。（很奇怪，清朝文吏似乎没有对他的供述做任何“加工”）他的供述中只是稍有美化“李宫保”之句一二，并自揽责任，表示张宗禹往西北是出于己命。
由于李鸿章怕递解北京途中捻部余众会劫人，便下令把赖文光在扬州凌迟，时为1868年1月10日。
至此，东捻军和赖文光一起，走到了尽头。
下录赖文光《自述》，以为参考：
尝闻英雄易称，忠良难为，亘古一理，岂今不然？唯予生长粤西，得伴我主天王圣驾，于道光庚戌年秋，倡义金田，定鼎金陵，今既十有八载矣。但其中军国成败，事机兴亡形势，予之学浅才疏，万难尽述；唯有略书数语，以表予之衷肠耳。
忆予于太平天国壬子二年，始沐国恩，职司文务，任居朝班。于丙辰六年秋，军国多故之际，正是君臣尝胆之秋，是以弃文而就武，奉命出师江右招军，以期后用。荷蒙主恩广大，赏罚由予所出，遇事先行后奏，其任不唯不重矣。丁已［巳］七年秋，诏命回朝，以顾畿辅。戊午八年春，我主圣明，用臣不疑，且知予志向，命往江北，协同成天安陈玉成佐理战守事宜，永固京都门户。受命之下，兢业自矢，诚恐有负委命之重，安敢妄怨有司之不从？且云忠言逆耳，良药苦口，诚哉是言也。于辛酉十一年秋，安省失守，斯时予有谏议云：当兹安省既失，务宜北连苗、张，以顾京左；须出奇兵，进取荆、襄之地，不半年间，兵多将广之日，可图恢复皖城，俾得京门巩固，以为上策。奈英王等畏曾中堂如神明，视楚师如罴虎，是以英王不从予议，遂率师回庐，请命自守，复行奏请加封予为遵王，推［唯］命与扶、启王等远征，广招兵马，早复皖省等情。此乃英王自取祸亡，累国之根也。又有忠王李秀成者，该不知机，遗［违］君命而妄攻上海，不唯上海攻之不克，且失外国和约之义，败国记家，生死皆由此举。
电光飞火走游龙（8）
至辛酉年底，予偕扶、启王等勉强遵照，由庐渡淮，那时予知有渡淮之日，终无转淮之期。是以直进武关，越秦岭，抵中原，出潼关，于壬戌十二年冬，由郧阳而进汉中，一路滔滔，攻无不克，战无不胜。于甲子十四年春，由汉中还师东征，图解京都重困。未果，以致京都失守，人心离散。其时江北所剩无所归依者数万，皆是蒙、亳之众，其头目任化邦、牛宏升、张宗禹、李蕴泰等，誓同生死，万苦不辞，请予领带，以期报效等情。此乃官兵好戮无仁之所致也。诚所谓不可行一不义，杀一不辜。如此思之，诚哉千古不易之良言也。予视此情状，君辱国亡家散之后，不得已勉强从事，竭尽人臣之忱，而听天命。
不觉独立此间数载，战无不捷。披霜踏雪，以期复国于指日。谁意李宫保者，足智多谋，兵精而将广，且能仰体圣化，是以人人沾感仁风不已。予虽才微识浅，久知独力难持，孤军难立之势，于丙寅十六年秋，特命梁王张宗禹、幼沃王张禹爵、怀王邱远才等，前进甘、陕，连结回众，以为犄角之势。当兹大事至此，无乃天数有定，夫复何言！古之君子，国败家亡，君辱臣死，大义昭然。今予军心自散，实天败于予，予何惜哉！唯死以报邦家，以全臣节焉。唯祈道台吴兄大人鉴照，早速裁处是荷。
西捻军方面，他们在1866年秋与赖文光等人分手后，年底已经进入华州、渭南一带，与陕西、甘肃起事的回民相互呼应。1867年年初，他们在临潼附近大败清军，打死打伤清军数千人。
此后，西捻军围西安。围攻不成，西捻军与回民军联合攻杀，在乾州大战清军，却反被对方严重杀伤。
连连受挫情况下，西捻军战略方面再次失误，渡渭河而北，从而陷入了极大的被动局面。不久，刺猬效应出现，捻军与造反回民日久生隙，相互攻杀。双方内耗下，他们的实力一步一步弱下去。
由于清朝大帅左宗棠自湖北追击捻军赶至陕西，在此一省的官军人数已达四万多人。由此，捻军的下场基本可知。
其实，西捻军一度还似乎出现过转机。为了援救当时陷入绝境的东捻军，张宗禹一度进犯京津地区，想来个“围魏救赵”，解除东捻军的压力，吸引官军集结回转保卫北京。
西捻军确实厉害。他们渡过黄河后，风驰电掣一般，直向豫北方向挺进，在1868年1月27日渡过漳河后进入直隶地区。2月3日，西捻军马队声势浩大地攻打保定，一直扑向京城，前锋军竟然进至芦沟桥，使得清廷大骇。
定下心神后，清廷诏谕各方勤王。一时间，山东、河南、安徽等地清军快速向北京方向集结，西捻军在人数上顿呈劣势。西捻军知道力不能敌，开始后撤。
由于东捻军已经覆亡，西捻军“围魏救赵”计划不仅实际上已经失败，又把自己陷入了进退失据的危险地步。
左宗棠受命，总督直隶境内各部清军追剿西捻军，采取且防且剿的方法，一口一口吃掉西捻军的有生力量。
3月下旬，西捻军从直隶退入河南临漳。李鸿章等人一顿大忙，实施圈制计划，想在黄河、运河、卫河、沁河之间把西捻军消灭掉。
但是，4月17日左右，西捻军在盐贩子集团引导下从东昌附近渡过运河，仅用三天时间就奔至德州一带。到了4月27日，西捻军已经逼近天津杨柳青。
这下不得了，天津的洋人非常紧张。他们忙与清军协作，把西捻军阻拦于天津外围。
攻天津城不果，西捻军南撤。日后，不少学者大费周章研究西捻军从北京撤围后的行进方向，有的说他们计划周密，有的说他们是使用“迂回战法”，议论纷纷。其实，彼时的捻军战法，什么都不是，完全是流寇主义的最后表演，穷途末路之下，他们走一步算一步，根本没有什么远大的目标和战略。
由于山东的海丰、武定一带多粮，张宗禹见状大喜，放松了神经，自恃有粮有马，准备在这个地区休整一段时间。
电光飞火走游龙（9）
其实，此地濒海临河，最不利于马队驰骋。西捻军如东捻军一样，最终自入绝地。
在李鸿章、左宗棠等人的指挥下，清军收紧包围圈。西捻军多次突围不成，边打边减员，马匹辎重损失严重。
在众多清军的围追堵截下，西捻军越战越少，特别是7月30日的济阳之战，捻军主力丧失殆尽，只余数千人苟延残喘。
8月16日，刘铭传、郭松林等部清军在荏平广平镇把残余西捻军近乎全歼，张宗禹只率十八名骑兵突围。
他们跑到徒骇河边，潜水游到对岸逃走。
十几个人又困又乏，逃出重围后找个地方昏昏睡去。
早上醒来，跑出重围的十几个捻军发现，大头目张宗禹不知所踪，只留下一双穿烂的破鞋在原处，其下落成为千古之谜。
解放后有人考证说他躲到沧州临海一带，一直活到1892年才病死。这种“考证�