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“当那次我的灵魂被分裂，留了一部分在二号机之中后，原本身体的残破灵魂时而清醒时而混沌，清醒的时候我能够想明白他们为什么要我亲身参与实验，混沌的时候我甚至连明日香都记不清楚了…”恭子脸色难看地说道：“直到后来我的死亡，临死前我终于想明白了究竟是怎么回事，不过很可惜，就算想明白了也无力去抗衡这个已经被决定好的阴谋和命运！”
“他们竟是想把我全部的灵魂都被束缚在二号机之中！那次出现的实验事故，不如说完全是他们故意制造的实验流程而已，为的就是抓走我的灵魂…呵呵，实验中我的运气不错，并没有让他们的阴谋就此成功~”恭子微微自嘲地说了一句：“可是身为科学家的我还是小看了人类的残酷和罪恶…为了达成目的，他们最终谋杀了发疯的那个我，并且伪装成我发疯上吊自杀的现场，最后将我留在原本身体中的那部分残破灵魂也是送入了二号机，终于达成了他们的目标——将完整的人类灵魂注入到EVA这个容器中！”
“这么做有什么用呢？”…“呵呵~真嗣君还不明白吗？明日香为什么会被选为二号机的驾驶员，虽然她有着优异的表现，但是更重要的是，她是灵魂被束缚在EVA容器中的人的女儿啊！”恭子的笑容有些森寒，有些绝望，一如明日香小时候被选为EVA驾驶员后回家向母亲报喜，看到高高吊在房间里晃荡的尸体时的表情！
“当时有一个理论，在旁人看起来也许有些荒谬，但是毫无疑问，这个理论是可以实现的！因为EVA是巨大的人造人，虽然复制了亚当的躯体，但是没有灵魂的驱动，依然是不可能动起来的！而想要让EVA动起来，必须由第二次冲击之后诞生的孩子来驾驶才行…可是人类终归是得不到满…足的贪…婪野兽！”恭子原本柔和的表情上充满了仇恨，她的软玉小手紧紧地握住了真嗣的手，想要在回忆黑暗往事的过程中得到一丝安全感和依靠~很显然，真嗣早就变得厚重沉稳的大手的支持，是她此刻最需要的东西！
“仅仅是选出优秀的EVA驾驶员根本无法让他们停止禁…忌的实验，因为普通的驾驶员虽然能够启动EVA，能够驾驶EVA，但是毫无例外地，他们与EVA的同步率非常低，低到想要抬一下手臂都做不到，这样的EVA根本形成不了战斗力，所以那些人想到了那个理论…”恭子缓缓地闭了闭眼睛：“那个理论就是，让直系亲人的灵魂进入到EVA内部，将EVA当成她们灵魂的容器，然后让她们的子女进入EVA驾驶…”
“这就像让自己的孩子重新回到自己体内，重新成为一个婴儿在母亲的体内存活、居住一样…母亲的身体可以最大限度地保护孩子的生命，母亲的心跳能够永远地和自己的孩子保持一致，为自己的孩子提供一切维持生命的需要，母亲的灵魂能够永远地与肚子里的孩子产生共鸣！这么一来不仅能够保证在启动EVA的神经接触时，不会产生各种脉冲逆流，更能保证驾驶员与EVA的高同步率，以及同步率的持续提升！还有什么能够比母子关系、母女关系更能维系彼此高度同步的呢！？”
恭子最后轻轻地叹了一句：“因为沉迷工作的关系，我变成这副样子更像是罪有应得，可是明日香是无辜的，她…什么都不知道，就被推到了最前面，成为保护人类的屏障…”
“原来…原来这就是事实啊…呵呵~哈哈哈！原来这就是我一直没有回忆起来的事实！”听了恭子的话，真嗣的脸色凝固在那里，但是却依然能够笑出声来，声音干涩、嘶哑，就像看到丽受伤的时候一样，心被撕裂的痛再度侵袭了真嗣的肉…体和灵魂！
“他们…他们竟然连人类最最神圣的生命延续仪式，最最无私的亲情母爱，最不可分割的肉…体灵魂的链接都要利用…呵呵~说的好听，为了击败使徒，为了保护全人类，为了人类文明的延续……其实是为了实现自己的目标、欲…望和野心吧，至高的权力者群体，SEELE委员会！还有…碇源堂！”真嗣冷冽的语气让站在他身边的恭子微微一惊，随即她竟是看到着眼前这个漂亮男孩脸上毫无征兆出现的两行液…体…
“真嗣君！？你…为什么哭了？”恭子看到真嗣莫名出现的泪水，不知怎地内心一阵刺痛~她赶忙将眼前的少年拉到眼前柔柔地注视着，同时伸出温暖的手帮真嗣拭去了从他眼中滑落的两道湿痕…“因为…其实我和明日香是一样的啊，恭子姐姐…”
“你！？碇…碇真嗣…你难道是？”身为德国支部“亚当复生计划”参与者的恭子，自然知道EVA领域里处于世界顶尖地位的那个女人~看着眼前的少年沉默的样子，恭子鼻子一酸忍不住将他搂进了怀里，紧紧地抱着，试图用她只是灵魂体的意识和动作，来抚平少年心中难愈的伤……
——嘀嘀~“真嗣君！？你感觉怎么样？”律子的语气微微焦急地说道，她的声音正从二号机的通讯器里传出…在二号机启动并进行神经连接后的几分钟里，真嗣的意识一直处于与二号机深层对接状态，也就是他见到小萝莉明日香以及明日香的妈妈那段时间，而这段时间里律子从实验室监测到真嗣与二号机的同步率，竟是达到了恐怖的六十五！
随后在律子的询问中，真嗣完全没有回复，因此才有了此刻她的焦虑~“唔~没事，只是在驾驶舱里睡了个觉，呵呵~”真嗣回过神来答应了一声，同时轻舒口气…因为回到现实的关系，他的情绪已经镇定了很多，加上刚才恭子温暖怀抱的安慰，他已经彻底恢复到了平静无波的程度。
“八——嘎！果然是八嘎真嗣，竟然在人家的二号机里睡觉，气死我了…啊！？你不会在我的驾驶舱里面流口水吧？”明日香一直站在实验室里看着真嗣的启动测试，虽然挺不爽自己的同步率被真嗣刷新的，但她又为真嗣能够完美地驾驶她的二号机而开心不已。
“噗哈哈~对哦对哦，流了好多好多，我全部的口水全流到驾驶舱里去了啊…”…“八嘎！你去死，我要杀了你这个恶心鬼！”…明日香一定又是气得捏起小拳头抗议示威了，真嗣暗暗地猜测着~对于恭子为什么一直没有告诉明日香真相，反而找上了自己，真嗣渐渐地有些理解了：也许，什么都不知道，比起明明知道妈妈在EVA中却什么都做不到，要幸福得太多太多…
如果明日香知道自己妈妈的灵魂一直寄宿在二号机中，自己整天操纵着妈妈的灵魂容器，并且经常和使徒作战受伤，那么以后她很可能就会完全无法驾驶二号机，同时也根本无法迎击使徒！所以，为了让明日香可以无所顾忌地继续着她的快乐和战斗，不被曾经的阴影和悲伤的情绪干扰到，恭子最终打消了通过神经连接，将残酷到令人难以接受的事实真相告诉明日香的想法…
至于真嗣，在得知了妈妈和初号机的真相后，结合三岁那年的记忆以及前世的记忆，他已经再次明确了自己的敌人，究竟是谁！而且让真嗣能够迅速平静下来的一件事是，他已经找到了属于他一个人的诺亚方舟！妈妈，我们很快会见面的，我一定可以…真嗣在二号机的插…入栓中握紧手心，暗暗地呢喃着~
——结束二号机和初号机的机体互换，休息了一会儿后，实验室里的所有人再次投入到零号机和初号机的机体互换实验的工作中…此时是丽在初号机中的启动测试，而真嗣则是点着烟站在实验室的落地窗前，静静地看着搭载丽启动的初号机~
此刻因为知道了妈妈的所在，加上一直以来初号机的诡异讯息、莫名重启动以及恐怖暴走，真嗣差不多已经明白了以往几次战斗的真实情况…也许他本身的战斗力很强，也许他跟EVA的同步率挺高，但是如果没有妈妈的灵魂存在于初号机体内，那么以往的好几次危机都足以让初号机和真嗣彻底死去！但这又是个矛盾的存在，当知道EVA中存在着妈妈的灵魂，对于这样失去人性、利用一切的做法，又是让人难以接受的…
不过，真嗣不会因为感觉到矛盾、恶心而停住脚步，在他眼里过去已经是过去了，最重要的是把握好现在和未来，而想要把握好现在和未来中自己的命运，犹犹豫豫、婆婆妈妈可是不行的！只有不断地增强自身的实力和初号机的实力，才能在这残酷地世界中拥有说话的权利，同时也能保护自己想保护的，拯救自己想拯救的……
“丽已经上来了，真嗣君，你快去准备吧~”律子看了看微微有些凝神的真嗣说道…原来在真嗣愣神的时候，丽已经完成了初号机的启动测试，现在轮到他去零号机上进行启动测试了…“知道了~”真嗣点了点头，快速走出实验室，走向机库的方向~
——“开始A10神经接触…同步水平＋20…”摩耶的声音继续在真嗣耳边回响，此时他已经坐在零号机的驾驶舱中开始了机体启动…“嗯！？”在真嗣专注地等待着神经连接的瞬间，有一股完全不同的感觉传进了真嗣的意识中。。。
一幅幅关于丽的场景不断地从真嗣的记忆中被扯出，不断纷乱地回放着曾经的一幕幕…从第一次来第三新东京市，在大街上见到了隐隐约约的丽的身影，到一次次在学校天台一起吃午餐便当，到抱住刚刚赤身从浴室出来的丽…一幅幅一幕幕的场景不断拉过，最后定格下来，一阵星星点点的血腥红色之后，一个表情狰狞的丽突然出现，猛地扑向真嗣！
“该死！零号机有问题律子…”真嗣只来得及说出一句话，零号机上的通讯便被强行切断！一直以来零号机的启动OS都是以真嗣的思考方式制作的，并且一直运行得很稳定，所以他根本没有预料到在他进行驾驶的时候，零号机会突然发生暴走……
嗷呜！一阵熟悉而沉闷的吼声后，零号机猛地开始挣脱背后的最终约束器。轰轰！零号机强大的力量很快将约束器拉出墙壁一段距离，同时扯出了隐藏在墙壁背后的众多电线…
嘟嘟！警报声在实验室区域响起，“驾驶员神经脉冲发生异常，脉冲发生逆流！”…“开始出现精神污染！中枢神经末梢开始拒绝信号！”摩耶焦虑地喊道…“怎么可能，这种栓体深度是不会出现这种情况的！？”律子惊疑不定地说道。
“自我心里函数不稳定，内部连接陆续断开，不是栓体的问题，是来自EVA的侵蚀，无法进行动态观察了律子姐！”…嗷吼！又是一声沉闷地嘶吼，零号机彻底地将约束器整个拉了出来！“自动制动系统没有反应，传导线路无法修复，EVA零号机彻底失控！”摩耶紧皱眉头看向律子，等待她的命令。
“关闭所有回路，切断电源！”律子见已经完全失控，立刻下了命令…哧！零号机背后的脐带电缆接口发出一阵喷气声，整个巨大的插…头脱离了零号机，落在了地面上，而零号机则是双手抓住脑袋在痛苦地挣扎着…“零号机切换为预备电源，仍在运作当中！”
在平时没有使徒来袭，进行机体实验的时候，为了以防万一，预备电源的持续时间一般为一分钟，这样既可以防备使徒的突袭，又可以防止实验中EVA的暴走~只有一分钟的暴走时间，要比五分钟的暴走时间安全太多了…
“真嗣君的情况怎么样！？”美里走到日向诚身后焦虑地问道。“回路关闭，无法检测！”…“零号机这是在拒绝真嗣君吗！？”律子脸上挂满了不解。“不行！自动弹出装置无法启动！”这下摩耶彻底慌了神，因为自动弹出插…入栓是最后一个保护驾驶员的方法了！
“难道又要跟那时候一样么！？”律子想起了那次让丽重伤的暴走……实验室里一片忙碌和慌乱，但是他们根本无法插手和控制EVA零号机的暴走，此时实验机库中零号机双手抱住脑袋，仿佛在寻找着什么，很快他的巨大独眼就盯住了前方实验室窗户前站着的那个穿白色作战服的少女。。。
“该…该死的！”真嗣捂着脑袋摇了摇头，他被刚才的一阵震荡给晃晕了~因为已经与零号机的神经连接彻底断开，此时是零号机本身产生的动作，所以真嗣会被零号机的各种动作给影响到，不过幸好他经常和明日香去F22上面玩超常规机动，零号机这种程度的震荡对他还造不成太大的影响和伤害。
“喂喂！你想干嘛！？”真嗣看着零号机举起拳头朝着实验室的窗户走去，目标俨然是窗户前的丽，这下彻底让他绷紧了神经！虽然实验室的防护壁和玻璃窗都是特制的，但是也经不起EVA几拳打呀，这一拳下去如果砸穿了墙壁和玻璃，那站在窗户前的丽还有命么！？“丽！快点离开窗户啊！”真嗣坐在驾驶舱里大呼小叫，可是根本不可能让丽听到…而比较诡异的是，丽好像并不惧怕举起拳头朝自己走来的零号机，只是站在窗户前静静地看着他走来…
丽可以做到完全不惧怕零号机，但是真嗣不行啊！他可不敢赌零号机一定不会伤到丽，或者在预备电源用尽之前他会自己停下来。。。眼看着实验室的窗户就在眼前，而自己搭乘的零号机又失控地举起拳头，即将朝站在窗户前的丽挥落拳头，真嗣的心中突然燃起了一股无名怒火！“暴走…暴走…暴走！你的暴走只会用来对付孱弱的人类吗，亚当的复制体就只是这副德性！？只会在这里发怒欺负人类，灭杀柔弱的女孩子么！？既然你这么喜欢暴走，就让你看看真正的暴走是什么样的…妈妈，帮帮我！”
嗖！零号机的拳头挥落，直挺挺地砸向丽身前的窗户…呯！就在所有人以为零号机的拳头要落在实验室的窗户上，纷纷为即将到来的冲击做好准备时，一声清脆而耳熟的声响在实验机库中回荡着…
“A…A。T。field！？”美里目瞪口呆地看着窗户外面不断散发着正多边形光斑的橙色屏障，惊疑不定地跑到了完好无损的窗户边，而律子、摩耶和其他NERV职员也是惊异地看着窗户外面诡异出现的橙色屏障，一脸难以置信的表情~
嗡嗡！只见距离窗户不到一米的空间上，诡异地出现着一面薄薄的橙色屏障，挡在了零号机和实验室之间，完全挡住了零号机的拳头攻击，此刻这道橙色屏障正以零号机的拳头为中心，缓慢有节奏地往四周扩散着正多边形光斑…
轰~吱呀！又是一阵令人牙酸的钢铁扭曲声，离零号机不远处的一个最终约束器上，站出了一台与零号机同样高大的EVA，不过她身上的紫色涂装、尖锐独角和森冷凤目，让她有了完全不同于零号机的高贵气质！此时有着紫色涂装的EVA正轻描淡写地伸出一只手臂，大手手心朝前平展着，对着的方向正好位于零号机前面的空间…
“初…初号机！？”美里差点被眼前的一幕给吓死！已经拔出外接电源，拆掉预备电源的初号机，此时竟然挣脱了最终约束器，堂而皇之地站在了零号机侧面的不远处~这么一来就好解释了，突然出现的A。T。field是从何而来…不过一个新的问题随之而来，美里知道初号机有重启动和暴走的先例，再来一次也没什么好奇怪的，可问题是初号机的正印驾驶员此刻正在零号机上面呆着，没有人驾驶的初号机是怎么重启动，怎么打开A。T。field的！？
想到这里美里不由想起了真嗣刚来第三新东京市的时候，站在初号机前发生的那一幕…那时候真嗣为了保护丽，准备用身体硬抗从天而降的钢条和灯管，结果谁也没料到完全没有能量支持的初号机，竟然会在那一刻抬起手臂，帮真嗣挡住了砸下来的所有东西，保护了真嗣和丽…难道初号机本身就有着自主的意识！？看着眼前诡异的一幕，美里不由产生了浓浓的疑惑…
而站到窗户前的律子也是瞪大了眼睛，紧紧地盯着远处自主打开约束器，自主展开A。T。field保护丽